Secuenciación genómica ¿Mejora en control de resistencias microbianas?

Se plantean en este informe propuestas para actualizar la monitorización y notificación armonizadas de la resistencia antimicrobiana (AMR, por sus siglas en inglés) en animales de de abasto y sus productos cárnicos en la UE , desde una perspectiva de salud pública en Salmonella, Campylobacter coli, Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium y  Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA); explicando las tendencias recientes en la AMR, las necesidades de recopilación de datos y los nuevos avances científicos.

Se refuerza el monitoreo fenotípico de AMR en aislamientos bacterianos, utilizando métodos de microdilución para evaluar la susceptibilidad e interpretar la resistencia usando valores de corte epidemiológicos e incluyendo una caracterización adicional de aquellos aislamientos de E. coli y Salmonella que muestran resistencia a las cefalosporinas y carbapenems de espectro extendido como el monitoreo específico de ESBL / AmpC / E. coli ,productor de carbapenemasa.

• Las combinaciones de especies bacterianas, animales de consumo y sus derivados cárnicos, así como los paneles antimicrobianos, se han revisado y adaptado, según se ha considerado necesario.Teniendo en cuenta los diferentes tamaños de muestra, se han realizado simulaciones numéricas para evaluar la potencia estadística relacionada, disponible para evaluar la ocurrencia y las tendencias temporales de la resistencia, con una precisión predeterminada, y para respaldar la elección del tamaño de muestra armonizado.Los procedimientos de muestreo aleatorio, basados en un proceso de muestreo estratificado genérico proporcional, se han revisado y reforzado. Se presentan propuestas para mejorar la armonización del monitoreo de prevalencia, diversidad genética y AMR en MRSA.